农科院研究团队揭示蓬蓬棉基因组分化特征为拓宽陆地棉遗传多样性提供理论依据和材料基础
本报三亚6月9日电(记者黄媛艳通讯员刘记)中国农业科学院棉花研究所杜雄明团队利用遗传学和全基因组关联分析等方法,系统地研究了一种在海南省多地生长了数百年的陆地棉半野生棉——蓬蓬棉,揭示了其进化地位,为拓宽陆地棉遗传多样性提供了理论依据和材料基础,相关研究结果近日发表在《遗传学与基因组学杂志》上。
杜雄明团队通过研究分析蓬蓬棉、中美洲半野生棉和现代栽培种群体的基因型发现,蓬蓬棉是一个相对古老的陆地棉半野生棉,可能是数百年前地理大发现时代随全球贸易商船或洋流运动传入我国境内。群体比较结果表明,蓬蓬棉基因组上携带一些特殊单体型区段,与中美洲陆地棉半野生棉和现代栽培种均存在差异,这些染色体区段对重新认识陆地棉在我国的引进和驯化历史,进一步拓展现代栽培陆地棉的遗传多样性具有重要意义。该研究还利用蓬蓬棉光周期敏感、纤维产量低和品质差等特性,采用全基因组关联分析(GWAS)方法鉴定到大量与开花期、纤维产量和纤维品质相关的SNP标记,这些标记所在的单体型区间为进一步发掘相关性状功能基因奠定了重要基础。
据悉,蓬蓬棉在海南分布较广,其四季都开花,也被称作“四季棉”。由于蓬蓬棉种质资源稀少而缺乏系统研究,其进化地位此前一直未得到确认。
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